2017_06_15_ru

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ И ПАСПОРТИЗАЦИЯ КЕМЕРОВСКОЙ ПОРОДЫ СВИНЕЙ НА ОСНОВЕ STR-АНАЛИЗА

 

В.Р. ХАРЗИНОВА1, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник (e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. 
Е.В. ГРИБОВСКАЯ, аспирант
К.В. ЖУЧАЕВ2, доктор биологических наук, декан (e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.)
О.В. КОСТЮНИНА1, доктор биологических наук, зав. лабораторией (e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.)
М.Л. КОЧНЕВА2, доктор биологических наук, зам. декана (e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.)
С.М. ЧЫДЫМ2, аспирант (e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.)
Н.А. ЗИНОВЬЕВА1, доктор биологических наук, академик РАН, директор (e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.)
1Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства им. Л.К. Эрнста, пос. Дубровицы, 60, Подольский р-н, Московская обл., 142132, Российская Федерация
2Новосибирский государственный аграрный университет, ул. Добролюбова, 160, Новосибирск, 630039, Российская Федерация

Резюме. Генетическая паспортизация и идентификация свиней – актуальная задача в селекционно-племенной работе. Для этого используют микросателлиты (STR-маркеры). Цель исследований – генетическая идентификация и паспортизация локальной кемеровской породы свиней с использованием STR-анализа, оценка ее генетического разнообразия и степени дифференциации, в сравнении с другими локальными и коммерческими породами. Исследования проведены в 2017 г. на 79 животных трех локальных пород – кемеровская (KEM, n = 31), беркширская (BER, n = 29), крупная черная (LB, n = 19) и 121 особи трех коммерческих пород – крупная белая (LW, n = 64), ландрас (L, n = 21) и дюрок (DU, n = 36). Для исследований брали образцы ткани (ушной выщип) свиней из коллекции банка генетического материала домашних и диких животных и птицы на базе ВИЖ им. Л.К. Эрнста. Геномную ДНК выделяли с использованием колонок «Nexttec» (Германия) согласно рекомендациям фирмы-изготовителя. Полиморфизм десяти STR-маркеров (SW24, S0155, S0355, S0386, SW72, SW951, S0101, SW240, SW857и SO005) определяли по собственным методикам на ДНК-анализаторе ABI3130xl («Applied Biosystems», США). Статистическую обработку результатов проводили с использованием пакета MS Excel 2007 с плагином GenAIEx v. 6.5. Генетическую структуру изучаемых пород оценивали методом кластеризации в программе STRUCTURE v. 2.3.4. Кемеровская порода имеет наименьшие значения наблюдаемой степени гетерозиготности, в сравнении с породами ландрас, дюрок и крупной белой: 0,554±0,054 против 0,635±0,082, 0,567±0,092, 0,762±0,053 соответственно. Однако превосходит по величине этого показателя локальные породы (крупная черная и беркширская), у которых она составляет 0,542±0,079 и 0,499±0,072. Кемеровские свиньи характеризуются наибольшими значениями среднего (Na) и эффективного (Ne) числа аллелей, уступая только крупной белой породе (NaKEM = 5,000±0,645, NaLW = 5,556±0,852, NeKEM = 3,295±0,384, NeLW = 3,305±0,446). Все исследованные породы формируют свой кластер с высокой степенью консолидированности, что свидетельствует об уникальности их аллелофонда.

Ключевые слова: кемеровская порода, свиньи, ДНК-паспортизация, STR.

Для цитирования: Молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация кемеровской породы свиней на основе STR-анализа / В.Р. Харзинова, К.В. Жучаев, О.В. Костюнина, М.Л. Кочнев, С. М. Чыдым, Н.А. Зиновьева // Достижения науки и техники АПК. 2017. Т. 31. № 6. С. 62-64.