Н.А. АКОПЯН, аспирант, младший научный сотрудник (e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.)
О.В. КОСТЮНИНА, кандидат биологических наук, рук. отдела
Н.А. ЗИНОВЬЕВА, доктор биологических наук, академик РАН, директор
Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства имени академика Л.К. Эрнста, п. Дубровицы, 60, Подольский р-н, Московская обл., 142132, Российская Федерация
Резюме. ДНК-маркеры – удобный инструмент в исследованиях по реконструкции происхождения пород домашних животных, в частности, свиней. Подтвержденное на молекулярном уровне синтетическое происхождение отечественных пород свиней ограничивает информативность ядерных ДНК-маркеров в исследовании их демографической истории. Анализ последовательности митохондриальной ДНК (мтДНК), имеющей материнский характер наследования, служит эффективным способом оценки исторического происхождения пород. Цель исследования – разработка тест-системы анализа последовательности фрагмента D-петли мтДНК и создание на ее основе серии референтных гаплотипов мтДНК свиней пород крупная белая и ландрас, чаще всего принимавших участие в формировании отечественного генофонда. Исследованная выборка представлена 50 гол. свиней крупной белой породы и 20 гол. породы ландрас различного происхождения. Подобранные олигонуклеотидные праймеры позволили амплифицировать фрагмент D-петли длиной 770 пар нуклеотидов, пригодный для секвенирования. Секвенирование и последующий анализ полученных последовательностей выявил наличие 26 различных гаплотипов свиней, в том числе 18 – у крупной белой породы и 8 – у породы ландрас. В суммарной выборке двух пород обнаружено 86 вариабельных сайтов. Большинство мутаций представлено транзициями. Соотношение транзиций к трансверсиям согласно теста Hasegawa-Kishino-Yano, модель (+I), составило R=3,84, среднее гаплотипическое разнообразие – h=0,0213±0,0127. Анализ дендограммы, построенной на основании полиморфизма фрагмента D-петли мтДНК, показал отсутствие четкой кластеризации по породному принципу. Вероятно, это обусловлено наличием общих предков и имевшим место обменом генами между породами. Предложенная тест-система позволяет секвенировать фрагмент D-петли мтДНК свиней длиной 770 пар нуклеотидов. С применением разработанной системы создана база референтных гаплотипов мтДНК пород крупная белая и ландрас, которая будет использована в дальнейших исследованиях для реконструкции демографической истории свиней отечественной селекции.
Ключевые слова: Sus scrofa domestica L., D-петля, митохондриальная ДНК, полиморфизм, генетическое разнообразие.
Для цитирования: Акопян Н.А., Костюнина О.В., Зиновьева Н.А. Исследование последовательности D-петли митохондриальной ДНК у свиней пород крупная белая и ландрас, разводимых в России // Достижения науки и техники АПК. 2016. Т. 30. № 7. С. 93-95.