Достижения науки и техники АПК

Теоретический и научно-практический журнал

Поиск

Авторизация

Авторизация

2021_08_06_ru

Исследование геномного инбридинга у коров ярославской породы

 

А. И. МИШИНА, А. С. АБДЕЛЬМАНОВА
Федеральный научный центр животноводства – ВИЖ имени академика Л. К. Эрнста, пос. Дубровицы, 60, Подольский р-н, Московская обл., 142132, Российская Федерация. E-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. 

Резюме. Наблюдаемое в течение последних десятилетий снижение поголовья локальных пород крупного рогатого скота может привести к значительному сокращению генетического разнообразия. Одна из старейших отечественных пород крупного рогатого скота – ярославская. За последние 30 лет ее численность уменьшилась почти в 15 раз. Исследования проводили с целью оценки геномного инбридинга у чистопородных животных ярославской породы. В качестве материала для исследований использовали сперму быков (n = 27) и кровь коров (n = 25). Группой сравнения при отборе генетически чистопородных животных ярославской породы служили животные голштинской породы (n = 15). Генотипирование осуществляли с использованием ДНК-чипов Bovine HD BeadChip и GGP Bovine 150K. Для оценки геномного инбридинга рассчитывали коэффициент инбридинга на основании длины пробегов гомозиготности (FROH) и показатель стандартизированной мультилокусной гетерозиготности (sMLH). Коэффициент инбридинга FROH варьировал от 6,97 % до 21,86 % и в среднем составлял 13,39 %. С использованием формулы Райта-Кисловского возможно обнаружить только последствия недавнего инбридинга (I…IV линия предков), в результате которого в геноме животного сформировались длинные гомозиготные участки. Коэффициент инбридинга, рассчитанный на основании полногеномных данных, позволяет отследить события, произошедшие более 5 поколений назад. Величины, характеризующие геномный инбридинг, определенные на основании FROH и sMLH, коррелировали с коэффициентом инбридинга, рассчитанным по родословной (r = 0,502 и r = -0,486). Они могут быть использованы для более точной, чем расчет по родословной, оценки инбридинга в популяции коров ярославской породы.

Ключевые слова: инбридинг, крупный рогатый скот, SNP, геномный инбридинг, ярославская порода, анализ родословной.

Сведения об авторах: А. И. Мишина, аспирант; А. С. Абдельманова, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник.

Для цитирования: Мишина А. И., Абдельманова А. С. Исследование геномного инбридинга у коров ярославской породы // Достижения науки и техники АПК. 2021. Т. 35. № 8. С. 30–34. doi: 10.53859/02352451_2021_35_8_30.