Достижения науки и техники АПК

Теоретический и научно-практический журнал

Поиск

Авторизация

Авторизация

2019_02_03_ru

Создание генетических паспортов подвойных форм яблони на основе анализа полиморфизма микросателлитных последовательностей ДНК

 

А. С. ЛЫЖИН, кандидат сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник (е-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.)
Федеральный научный центр им. И. В. Мичурина, ул. Мичурина, 30, Мичуринск, Тамбовская обл., 393774, Российская Федерация

Резюме. Анализировали полиморфизм микросателлитных локусов для генетической идентификации подвойных форм яблони M9, B9, 54-118, 62-396. Для этого сформировали диагностический набор из 10 микросателлитных маркеров (SSR-маркеров): CH01c06, CH01f03b, CH02c02b, CH02g04, CH03a04, CH03d12, CH04c07, CH04h02, CH05e04, CH05g08. Предложенный набор позволяет проводить надёжную идентификацию изученных подвойных форм яблони. Работу проводили в 2017–2018 гг. Повторность опытов 3-х кратная. Растительный материал подвоев B9, 62-396, 54-118 был взят в генетической коллекции Федерального научного центра им. И. В. Мичурина, подвоя M9 – в плодообъединении «Сады Ставрополья». Фрагментный анализ ПЦР-продуктов осущесвляли на автоматическом секвенаторе Applied Biosystems 3730 DNA Analyzer, позволяющем определять размер SSR-аллелей с точностью до одного нуклеотида. Полученные хроматограммы обрабатывали в программной среде GeneMarker V2.6.3. У изучаемых подвоев яблони анализируемый набор микросателлитов представлен 39 аллелями, размер которых лежит в диапазоне 94…202 п.н. Из 39 аллелей 37 – полиморфные, то есть позволяют выявить различия между образцами. Количество аллелей на маркер варьировало от 2 (маркер CH05e04) до 5 (маркеры CH02g04, CH04c07). Средний уровень полиморфизма изучаемых SSR-локусов составил 94,8 %, гетерозиготности – 82,0 %. Для подвоя M9 доля уникальных аллелей была равна 41,2 % при среднем уровне гетерозиготности 82,3 %; у B9 – 10,5 и 94,7 %; у 54-118 – 22,2 и 88,9 %; у 62-396 – 15,8 и 94,7 % соответственно. Невысокая доля уникальных SSR-аллелей у подвоев B9, 54-118 и 62-396 объясняется тем, что формы 54-118 и 62-396 получены с использованием в качестве родительской формы подвоя B9. На основании полученных данных сформированы генетические паспорта подвойных форм яблони.

Ключевые слова: яблоня, подвой, молекулярные маркеры, полиморфизм, генетический паспорт.

Для цитирования: Лыжин А. С., Соловченко А. Е. Создание генетических паспортов подвойных форм яблони на основе анализа полиморфизма микросателлитных последовательностей ДНК // Достижения науки и техники АПК. 2019. Т. 33. № 2. С. 11–13. DOI: 10.24411/0235-2451-2019-10203.